南涧县自2017年全面启动河长制工作以来，不断健全工作机制，压实工作责任，广泛宣传动员，汇集多元治河力量，做到每条河都有人管，实现了底数清、措施实、效果佳的目标。
南涧县地处国际性河流红河上游，境内有红河流域和澜沧江流域两大水系，河道总长286公里，共有60条河流、13座水库、145个坝塘、6条沟渠。为使境内河湖数、流域区、水源点等内容皆可从信息系统悉数查寻，做到底数清，南涧县重点编制了27条河流和水库的“一河一策”“一库一策”，建成河（湖）长制信息系统平台，将河（湖）长制工作经费纳入县财政预算，夯实河（湖）长制基础工作。同时编制完善县级河库名录及复核工作，印发《南涧县全面贯彻落实河（湖）长制的实施方案》，明确河（湖）长制职责任务。
南涧县将河（湖）长职责、部门职责、村居民职责等内容落实到行动上，做到措施实。2018年，全县聘请河长制社会义务监督员36名参与全县河库监督，更换县级河长公示牌33块，公示各段河长，公布责任单位、责任人、联系单位、联系方式等信息，主动接受社会监督。同时，让“河长制”宣传进校园，采取小手拉大手方式改变群众的思想观念，在全县形成了“爱护河（湖）全民有责”的共识。
在此基础上，南涧县编制了河道采砂规划，重点实施了集中式饮用水源地母子垦水库、大龙潭水库一级水源保护区实施水源地保护工程；开展污染源普查，加强排污许可管理；加大畜禽养殖防控，制定了畜禽养殖禁养区限养区可养区划定方案，实现畜禽养殖区域与污染物排放总量“双控制”；实施沿河绿化工程，对元江—红河（南涧段）生态脆弱带沿河岸种植柳树、竹子、三角梅，对乐秋河县城段、祥临公路和西山河河岸种植柳树、灌木树种及草坪，进行河岸美化绿化；制定《南涧县河长制水质监测方案（试行）》，设置36个水质监测点，开展了全县水质监测工作。通过开展水域岸线保护、水污染防治、水源环境治理、水生态修复等“南涧清水行动”，南涧县河（湖）保护治理取得了明显成效，实现了水清岸绿。